兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病急，進(jìn)展快開始的時候就可以表現(xiàn)為多系統(tǒng)多臟器同時受累，沒有積極的救治，其預(yù)后遠(yuǎn)遠(yuǎn)比成人嚴(yán)重，特別是病情緩解后又復(fù)發(fā)的，并有不能預(yù)料的惡化，他的生存率在近三十年，本病的五到十年，病死率有明顯的下降趨勢。
由于早期診斷水平的提高，糖皮質(zhì)激素，細(xì)胞毒性藥物的應(yīng)用以及有效的處理合并癥，定期的隨訪，根據(jù)病情調(diào)整用藥和治療方案，該病2015年的存活率目前大于80%。
影響預(yù)后的原因，兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡的預(yù)后，與疾病的活動程度腎臟損害的類型和進(jìn)展情況，臨床血管炎的表現(xiàn)，以及多系統(tǒng)受累的情況有關(guān)，彌漫性增殖性狼瘡腎炎和持續(xù)中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變的預(yù)后是最差的，兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡的死亡原因，常見的為感染，腎功能衰竭，中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病和腦血管意外，肺出血，肺動脈高壓和心肌梗死等。
