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首先根據(jù)患者的發(fā)病過程和臨床表現(xiàn)，可有一個初步的判斷，比如感染性的結(jié)膜炎，通常是雙眼發(fā)病并且可以累及家人，而大多數(shù)急性病毒性的結(jié)膜炎，最先是一眼發(fā)病，而后另眼發(fā)病。

沙眼的病變以上眼瞼為主，而病毒所導(dǎo)致的急性濾泡性結(jié)膜炎則是以下眼瞼為主，細(xì)菌性的結(jié)膜炎的卡他癥狀更為顯著，一般情況下可以做結(jié)膜刮片檢查，革蘭染色和吉姆薩染色初步確定病菌的種類，和結(jié)膜的炎癥反應(yīng)特點。

如果以中性粒細(xì)胞的浸潤為主，常提示細(xì)菌和衣原體感染，如單核細(xì)胞增多，只出現(xiàn)多核巨細(xì)胞，可能是病毒感染，如上皮細(xì)胞細(xì)胞漿中有包涵體，并且有淋巴細(xì)胞、漿細(xì)胞等等，則提示衣原體感染，也可以做結(jié)膜的細(xì)菌學(xué)檢查，或者是分泌物的細(xì)菌培養(yǎng)和藥敏試驗。