病原學(xué)診斷主要包括以下三個方面：
一、標(biāo)本采集和結(jié)核菌的檢測，標(biāo)本主要來源于包括痰液、超聲霧化導(dǎo)痰、下呼吸道采樣、支氣管沖洗液、支氣管肺泡灌洗液、肺及支氣管活檢標(biāo)本，涂片陰性不能排除肺結(jié)核，連續(xù)檢查大于等于3次可以提高檢出率，分離培養(yǎng)法靈敏度高于涂片電解法，可直接獲得菌落，便于與非結(jié)核分枝桿菌鑒別，是結(jié)核病診斷的金標(biāo)準(zhǔn)，未進行抗結(jié)核治療或者是停藥48-72小時的肺結(jié)核患者可以獲得比較高的分離率。
二、結(jié)核菌藥物性、敏感性監(jiān)測，對肺結(jié)核痰菌陰轉(zhuǎn)后復(fù)陽，化學(xué)治療3到6個月，痰菌仍持續(xù)陽性，治療菌群減少后有持續(xù)增加，即復(fù)治患者應(yīng)進行藥物敏感性監(jiān)測，原發(fā)耐藥率較高地區(qū)有條件時，初治肺結(jié)核也可行藥物敏感性監(jiān)測。
三、血清抗結(jié)核抗體檢測，血清學(xué)診斷可成為結(jié)核病的快速輔助診斷手段，但特異性強，敏感性較低。
